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真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案
时间：
2025-04-23
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测序数据质量优异，关键指标表现突出：

基础数据优秀：Raw Q30＞91%、Mapped rate＞99.4%、Adapter-Adapter＜0.003%

核心指标稳定：台间Peak count 和 FRiP 均表现出良好的稳定性和一致性


ATAC-seq和CUT&Tag作为研究染色质结构的前沿技术，可精准解析染色质可及性和蛋白-DNA互作。针对这两类文库常见多峰干扰的测序问题，真迈生物联合翌圣生物推出国产解决方案，采用高性能建库试剂和SURFSeq 5000测序平台，在保证数据质量的同时显著降低成本，为非标准文库测序提供了可靠选择。


真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案

图1. 标准文库-WGS（上图）和非标准文库-ATAC-seq（下左图）/CUT&Tag（下右图）峰图表现



01 测试


真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案


1、数据质量优异

  • Raw Q30均值达91%以上，且台间重复稳定

  • Adapter-Adapter rate低至0.003%，有效数据利用率极高

真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案


真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案

图2.下机数据表现


2、Mapping 统计

  • Mapped rate均值达99.4%，其中ATAC-seq的mapped rate 远高于ENCODE数据库标准的95%

  • 台间Peak count、FRip 表现稳定且一致

真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案


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真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案

图3.Mapping 比对分析



3、Peak 一致性分析

  • 信噪比高，且台间Peak 一致性高

真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案


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图4.台间Peak 一致性分析

ATAC-seq核心指标包括测序深度、TSS富集分数、FRiP、IDR、比对率、Peak count、Duplicate Rate和文库复杂度，核心指标参数可参考ENCODE数据库：https://www.encodeproject.org


02 产品订购


真迈×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非标准文库国产化解决方案


真迈生物与翌圣生物强强联合，充分发挥双方在酶制剂研发和测序平台构建领域的技术优势，共同打造覆盖“原料-设备-应用”全产业链的创新解决方案。通过构建开放共享的行业生态系统，持续为全球科研和医疗机构提供更精准、更高效的测序整体解决方案。

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