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真迈生物与专注于单细胞技术服务的寻因生物开展深度合作,双方整合技术资源优势,共同打造了高质量的国产单细胞组学整体解决方案,该方案将为推动单细胞技术应用和发展提供强有力的支持。
双方合作开展了单细胞整体解决方案的性能评价工作,评价采用了寻因生物单细胞免疫组试剂盒构建了多物种多组织样本单细胞文库,文库样本同时在SURFSeq 5000和NovaSeq 6000测序平台进行测试分析。
结果显示,SURFSeq 5000在Clean bases ratio以及单细胞文库质控中的多项指标均表现出色,其各样本获得read数、识别细胞数以及细胞中位基因数等指标均优于NovaSeq 6000。
测试方案
表1 测试方案
测试结果
下机数据质量高,Clean bases ratio表现更优
图1 下机数据对比
单细胞转录组文库质控结果优异,且各样本获得read数、识别细胞数、每个细胞中位基因数等方面表现更优
表2 单细胞转录组文库质控对比结果
共享cell barcode高达97%
图2 共享cell barcode对比结果
高变基因相关性高达99%
图3 高变基因相关性对比结果
注:每个点表示一个细胞表达基因分别在SURFSeq 5000 和 NovaSeq 6000平台中的 UMI counts 分布。
所有基因表达量相关性达90%以上
图4 所有基因表达量相关性对比结果
平台间一致性高
图5 细胞注释一致性对比结果
图6 细胞聚类对比结果
图7 各cluster中细胞比例结果
真迈生物与寻因生物联手打造的国产单细胞组学整体解决方案展现出了优异的性能与可靠性,该方案可为科研人员提供高质量的单细胞组学数据,成为推动大规模单细胞测序深入研究的重要工具。