读长更长，精准如一！真迈生物重磅推出 SURFSeq 5000 PE400 测序方案。单张芯片可产出超500M高质量reads，全面助力抗体库筛选、扩增子物种鉴定、基因编辑验证、细胞治疗质控等领域的创新和应用落地。

使用SURFSeq 5000 PE400 测序方案对GIAB WGS样本、单菌WGS样本和混合菌群标准品样本进行3轮测试，单芯片数据产出均值达722.61M reads，质量>Q30数据占比均值90.96%。

注：1.标称性能指标基于企业标准品测试；上述产出与 Output Q30 为本次三次重复整 FC 均值。

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PE400丨读长更长，精准如一

设置不同上样浓度，评估PE400方案产出表现：Run1(rep1)考察较低浓度上样条件，Run2(rep2)和Run3(rep3)在较高浓度下开展重复测试。三次单FC产出均超过500 M reads标称值，其中较低浓度条件下的Run1产出达656.50 M reads，仍高于标称值31.3%。

注：Run1采用较低上样浓度，Run2和Run3采用相同的较高上样浓度；三次测试产出均高于标称值。

图1 三次PE400测试单FC产出；比例为相对500 M reads规格的增幅

Q30/Q40高水平，Q-Cycle曲线稳定

三次测试的Output Q30均值为90.96%，Output Q40均值为85.47%。以三次测试中的GIAB WGS数据为例，Q-Cycle曲线高度重合，R1与R2整体质量变化趋势相近；在cycle 800末端，Mean Q仍接近36。

图2 WGS三次重复在800 cycles下的Mean Q变化趋势

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WGS丨长读长下，关键指标保持稳定

以GIAB标准品HG001开展三次WGS测试，统一下采样至200M read pairs。三次测试的比对率均值为99.83%，30×覆盖度均值为93.50%；SNP和INDEL F1均值分别为99.63%和93.84%。PE400方案可稳定支持人源WGS比对、覆盖及变异检测分析。

注：基于GRCh37（hg19）参考基因组和GIAB benchmark V4.2.1高置信区开展Germline分析；结果受benchmark版本、分析流程和参数影响。

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微生物de novo丨较低数据深度获得较高组装覆盖度

选取低GC的具核梭杆菌（约2.5 Mb，GC 27.9%）和高GC的铜绿假单胞菌（约6.4 Mb，GC 66%）进行多深度组装。具核梭杆菌在20×、铜绿假单胞菌在25×数据深度下，Genome fraction分别达到97.47%和98.96%，与各自100×结果（97.56%和98.99%）接近。本次结果表明，PE400方案在所测高、低GC微生物中，使用较低数据深度即可获得较高的组装覆盖完整度。

注：使用Unicycler对不同数据深度开展组装评估；表中为三次测试结果的均值。

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16S丨有效数据比例高，目标菌检出一致

采用ZymoBIOMICS 微生物群落标准品构建16S文库开展三次测试。三次测试的过滤通过率、双端拼接率和去嵌合后有效率均值分别为92.86%、92.60%和92.59%，8种目标细菌在三次测试中均被检出。本次结果表明，PE400方案在该16S测试中可获得较高的有效数据比例，并实现一致的目标菌检出。

图3 标准品理论组成与三次测试的物种相对丰度

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PE400丨全新读长，全新选择

PE400方案让SURFSeq 5000的读长往前走了一步，也让测序应用有了更多的可能。 真迈生物要做的从来不只是把读长做长——是让每一条读长，都能变成实验室里真正用得上的答案。让生命可读，让健康可塑，我们一直在路上。