GenoCare病原微生物检测,是基于宏基因组单分子测序技术快速对病原微生物进行检测的新产品。通过采集病原微生物样本,提取DNA并构建文库,在真迈生物GenoCare 1600单分子测序平台上进行测序,然后通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息,并出具全面深入的报告,这为疑难危重特殊感染的病原体检测等应用提供了一种新方法和新平台。
● 适用人群:疑似病原微生物感染的患者。
● 检测内容:获得待检测样品中疑似致病菌的种属信息
● 样本类型:脑脊液,肺泡灌洗液,咽拭子,痰液等。
● 测序平台:GenoCare1600单分子基因测序仪
● 样本量:4~16个样本/run
● 样本周转时间(TAT):18~36小时
GenoCare单分子测序平台与二代测序平台的比较

传统二代测序样品制备流程:

GenoCare单分子基因测序仪平台样品制备流程:

技术优势:

病原微生物宏基因组检测流程

模拟样品测试:
以人源样品,金黄色葡萄球菌,M13病毒及新冠病毒全长质粒,按照不同的添加比例进行混合,以分别检测在不同混入比例下单分子平台对于细菌及病毒样品的检测限。
数据分析:
经过数据过滤,使用5-10M clean reads进行去人源,同时在置信数据库中比对分析。获得样品中存在的菌种信息及菌种丰度。
模拟样品检测结果解读:
结果显示:其中金黄色葡萄球菌(S.aureus)检测限为十万分之一( 10个copy );M13检测限为百万分之0.5( 100个copy );SARS-CoV-2检测限为百万分之0.6( 100个copy ),模拟样品测序后的结果分析与理论混入比值比例一致。

临床样品测试:
利用GenoCare1600平台对疑似新冠病毒患者的咽拭子样品进行处理并测序,经分析比对至新冠病毒上的reads为5894条且比对至SARS-CoV-2基因组获得了97%的覆盖率,且平均覆盖深度为328×。

* 本产品仅供研究目的使用。